Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms