Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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