Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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