Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms