Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PFDN4Q9NQP4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFDN4Q9NQP4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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