Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms