Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms