Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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