Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms