Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms