Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms