Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CECR2Q9BXF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CECR2Q9BXF3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms