Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms