Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms