Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms