Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLF1Q9BQI6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLF1Q9BQI6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms