Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms