Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDC1Q96MU7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms