Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms