Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF496Q96IT1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms