Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms