Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms