Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C18orf8Q96DM3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms