Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms