Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms