Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms