Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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