Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms