Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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