Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms