Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54Q6NXT1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms