Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms