Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms