Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms