Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TWISTNBQ3B726 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms