Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Q1T7F1 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms