Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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