Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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