Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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