Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSX1Q16384 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms