Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CST6Q15828 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CST6Q15828 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CST6Q15828 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms