Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA6Q15825 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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