Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA2Q15822 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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