Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms