Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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