Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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