Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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