Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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