Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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