Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEUROD1Q13562 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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